Artwork

Nội dung được cung cấp bởi Roman Cheplyaka. Tất cả nội dung podcast bao gồm các tập, đồ họa và mô tả podcast đều được Roman Cheplyaka hoặc đối tác nền tảng podcast của họ tải lên và cung cấp trực tiếp. Nếu bạn cho rằng ai đó đang sử dụng tác phẩm có bản quyền của bạn mà không có sự cho phép của bạn, bạn có thể làm theo quy trình được nêu ở đây https://vi.player.fm/legal.
Player FM - Ứng dụng Podcast
Chuyển sang chế độ ngoại tuyến với ứng dụng Player FM !

#26 Feature selection, Relief and STIR with Trang Lê

1:08:43
 
Chia sẻ
 

Manage episode 219838510 series 1537951
Nội dung được cung cấp bởi Roman Cheplyaka. Tất cả nội dung podcast bao gồm các tập, đồ họa và mô tả podcast đều được Roman Cheplyaka hoặc đối tác nền tảng podcast của họ tải lên và cung cấp trực tiếp. Nếu bạn cho rằng ai đó đang sử dụng tác phẩm có bản quyền của bạn mà không có sự cho phép của bạn, bạn có thể làm theo quy trình được nêu ở đây https://vi.player.fm/legal.

Relief is a statistical method to perform feature selection. It could be used, for instance, to find genomic loci that correlate with a trait or genes whose expression correlate with a condition. Relief can also be made sensitive to interaction effects (known in genetics as epistasis).

In this episode, Trang Lê joins me to talk about Relief and her version of Relief called STIR (STatistical Inference Relief). While traditional Relief algorithms could only rank features and needed a user-supplied threshold to decide which features to select, Trang’s reformulation of Relief allowed her to compute p-values and make the selection process less arbitrary.

Links:

If you enjoyed this episode, please consider supporting the podcast on Patreon.

  continue reading

70 tập

Artwork
iconChia sẻ
 
Manage episode 219838510 series 1537951
Nội dung được cung cấp bởi Roman Cheplyaka. Tất cả nội dung podcast bao gồm các tập, đồ họa và mô tả podcast đều được Roman Cheplyaka hoặc đối tác nền tảng podcast của họ tải lên và cung cấp trực tiếp. Nếu bạn cho rằng ai đó đang sử dụng tác phẩm có bản quyền của bạn mà không có sự cho phép của bạn, bạn có thể làm theo quy trình được nêu ở đây https://vi.player.fm/legal.

Relief is a statistical method to perform feature selection. It could be used, for instance, to find genomic loci that correlate with a trait or genes whose expression correlate with a condition. Relief can also be made sensitive to interaction effects (known in genetics as epistasis).

In this episode, Trang Lê joins me to talk about Relief and her version of Relief called STIR (STatistical Inference Relief). While traditional Relief algorithms could only rank features and needed a user-supplied threshold to decide which features to select, Trang’s reformulation of Relief allowed her to compute p-values and make the selection process less arbitrary.

Links:

If you enjoyed this episode, please consider supporting the podcast on Patreon.

  continue reading

70 tập

Tất cả các tập

×
 
Loading …

Chào mừng bạn đến với Player FM!

Player FM đang quét trang web để tìm các podcast chất lượng cao cho bạn thưởng thức ngay bây giờ. Đây là ứng dụng podcast tốt nhất và hoạt động trên Android, iPhone và web. Đăng ký để đồng bộ các theo dõi trên tất cả thiết bị.

 

Hướng dẫn sử dụng nhanh