Artwork

Nội dung được cung cấp bởi Roman Cheplyaka. Tất cả nội dung podcast bao gồm các tập, đồ họa và mô tả podcast đều được Roman Cheplyaka hoặc đối tác nền tảng podcast của họ tải lên và cung cấp trực tiếp. Nếu bạn cho rằng ai đó đang sử dụng tác phẩm có bản quyền của bạn mà không có sự cho phép của bạn, bạn có thể làm theo quy trình được nêu ở đây https://vi.player.fm/legal.
Player FM - Ứng dụng Podcast
Chuyển sang chế độ ngoại tuyến với ứng dụng Player FM !

#35 The role of the DNA shape in transcription factor binding with Hassan Samee

1:01:45
 
Chia sẻ
 

Manage episode 238719696 series 1537951
Nội dung được cung cấp bởi Roman Cheplyaka. Tất cả nội dung podcast bao gồm các tập, đồ họa và mô tả podcast đều được Roman Cheplyaka hoặc đối tác nền tảng podcast của họ tải lên và cung cấp trực tiếp. Nếu bạn cho rằng ai đó đang sử dụng tác phẩm có bản quyền của bạn mà không có sự cho phép của bạn, bạn có thể làm theo quy trình được nêu ở đây https://vi.player.fm/legal.

Even though the double-stranded DNA has the famous regular helical shape, there are small variations in the geometry of the helix depending on what exact nucleotides its made of at that position.

In this episode of the bioinformatics chat, Hassan Samee talks about the role the DNA shape plays in recognition of the DNA by DNA-binding proteins, such as transcription factors. Hassan also explains how his algorithm, ShapeMF, can deduce the DNA shape motifs from the ChIP-seq data.

Links:

If you enjoyed this episode, please consider supporting the podcast on Patreon.

  continue reading

70 tập

Artwork
iconChia sẻ
 
Manage episode 238719696 series 1537951
Nội dung được cung cấp bởi Roman Cheplyaka. Tất cả nội dung podcast bao gồm các tập, đồ họa và mô tả podcast đều được Roman Cheplyaka hoặc đối tác nền tảng podcast của họ tải lên và cung cấp trực tiếp. Nếu bạn cho rằng ai đó đang sử dụng tác phẩm có bản quyền của bạn mà không có sự cho phép của bạn, bạn có thể làm theo quy trình được nêu ở đây https://vi.player.fm/legal.

Even though the double-stranded DNA has the famous regular helical shape, there are small variations in the geometry of the helix depending on what exact nucleotides its made of at that position.

In this episode of the bioinformatics chat, Hassan Samee talks about the role the DNA shape plays in recognition of the DNA by DNA-binding proteins, such as transcription factors. Hassan also explains how his algorithm, ShapeMF, can deduce the DNA shape motifs from the ChIP-seq data.

Links:

If you enjoyed this episode, please consider supporting the podcast on Patreon.

  continue reading

70 tập

Tất cả các tập

×
 
Loading …

Chào mừng bạn đến với Player FM!

Player FM đang quét trang web để tìm các podcast chất lượng cao cho bạn thưởng thức ngay bây giờ. Đây là ứng dụng podcast tốt nhất và hoạt động trên Android, iPhone và web. Đăng ký để đồng bộ các theo dõi trên tất cả thiết bị.

 

Hướng dẫn sử dụng nhanh