#40 Plasmid classification and binning with Sergio Arredondo-Alonso and Anita Schürch

the bioinformatics chat

Nội dung được cung cấp bởi Roman Cheplyaka. Tất cả nội dung podcast bao gồm các tập, đồ họa và mô tả podcast đều được Roman Cheplyaka hoặc đối tác nền tảng podcast của họ tải lên và cung cấp trực tiếp. Nếu bạn cho rằng ai đó đang sử dụng tác phẩm có bản quyền của bạn mà không có sự cho phép của bạn, bạn có thể làm theo quy trình được nêu ở đây https://vi.player.fm/legal.

4+ y ago 45:04

MP3•Trang chủ episode

Does a given bacterial gene live on a plasmid or the chromosome? What other genes live on the same plasmid?

In this episode, we hear from Sergio Arredondo-Alonso and Anita Schürch, whose projects mlplasmids and gplas answer these types of questions.

Links:

mlplasmids: a user-friendly tool to predict plasmid- and chromosome-derived sequences for single species (Sergio Arredondo-Alonso, Malbert R. C. Rogers, Johanna C. Braat, Tess D. Verschuuren, Janetta Top, Jukka Corander, Rob J. L. Willems, Anita C. Schürch)
gplas: a comprehensive tool for plasmid analysis using short-read graphs (Sergio Arredondo-Alonso, Martin Bootsma, Yaïr Hein, Malbert R.C. Rogers, Jukka Corander, Rob JL Willems, Anita C. Schürch)

If you enjoyed this episode, please consider supporting the podcast on Patreon.

70 tập

#Bioinformatics #Genetics #Algorithms #Ngs #Roman Cheplyaka #Biology #Science #Natural Sciences #Sequence #Genomics